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计算中出现三个原子在一条直线成180度时会报错，错误信息如下：Berny optimization. Using GEDIIS/GDIIS optimizer. Bend failed for angle 38 - 5 - 42 Tor ...,计算化学公社

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各位老师好，最近在计算一个分子和溶剂分子（甲醇）的氢键，做一个柔性扫描。做到一半，高斯报错，甲醇中的两个原子和目标分子中的一个原子键角为180°，导致一系列二面角 ...,计算化学公社

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计算过渡态用的是g09，老是出现内坐标报错，加cartesian又很难收敛，结构本身就有线性，不知道怎样办了，求助,计算化学公社

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计算两个大的有机分子在水中的弱相互作用，两个分子总共180多个原子，打算先用molclus+MOPAC或者XTB搜索能量低的构象，后再用molclus+Gaussian去再优化能量比较低的前一步 ...,计算化学公社

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我用DFT方法计算得到了一个四个原子小分子的过渡态，经过IRC检查没问题。想用CBS-QB3方法计算能量。使用的关键词是使用opt=Cartesian没能解决。给出的错误是：我 ...,计算化学公社

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当我在运行gmx pdb2gmx-f ...-p ...-water spce-ignh时候（模拟的是蛋白蛋白之间结合）出现了Fatal error: Atom O1 in residue HIS 180 was not found in rtp entry ...,计算化学公社

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各位老师好~最近在学习几何参数分析，对于高斯直接输出的二面角，怎么进行比较大小，有一点疑问。比如二面角-148.02度，代表什么含义呢？跟178.21度相比，哪个更大呢？谢谢 ...,计算化学公社

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vasp计算能带。先结构优化，再自洽（ISTART=0 , SIGMA=0.01,ICORELEVEL=1,LVTOT=T,LVHAR=T），最后非自洽 (ISTART=1,ICHARG=11)，PREC与静态一致，ENCUT不变。KPATH.in改为KP ...,计算化学公社

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见详谈使用Gaussian做势能面扫描http://sobereva.com/474由于图太多，30多张，三万字，懒得这里再贴一遍了。推荐所有Gaussian用户和 ...

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需要请教一下这个题目的过渡态结构用TS方法怎么搭建。谢谢,计算化学公社

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