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谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算 - 思想家公社的门口...
May 25, 2016 · 之所以这里刻意带了溶剂模型，是因为这一节试图给读者一套普适性的关键词、可以应用于各种体系。 对于整体或局部显离子性体系，不带溶剂模型优化出的结构与溶剂环境下的实际状态可能定性不符而无法接受，因此这套模板关键词索性就总是带着溶剂模型。
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谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算 - 量子化学 (Quantu...
May 25, 2016 · 谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算On the calculation of solvation free energy and system free energy via implicit solvent model文/Sobereva @北京 ...,计算化学公社
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量子化学||查找各种溶剂介电常数的方法 (Dielectric Constants)
查找Gaussian手册 查看一下 Gaussian手册（sobereva.com/g09/k_scrf翻到页面最后）中，这里有的溶剂可以直接调用，如果是使用这里出现的溶剂进行混合溶剂计算，可以从这里抄一下对应的介电常数，然后按照卢天老师的教程换算一下混合溶剂的介电常数。
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比SMD算溶解自由能更好的溶剂模型uESE的使用 -...
Apr 30, 2021 · 注意uESE模型在测试、拟合参数的时候对离子体系都是只考虑了带+1、-1电荷的离子。 高价离子与溶剂相互作用显著强于一价离子，笔者估计用uESE肯定不会得到较好结果，必须用杂化溶剂模型。
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显著改进SMD溶剂模型描述Br和I元素精度的溶剂模型SMD18的介绍 - 思想...
Aug 23, 2021 · 文/Sobereva@ 北京科音 2021-Aug-23 之前笔者在《谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算》（http://sobereva.com/327）中专门说过SMD溶剂模型，这是现阶段最适合算溶剂环境下体系能量的隐式溶剂模型。
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构建被显式溶剂层包裹的分子的简单方法 -...
Jan 20, 2018 · 加溶剂层比较严谨、可靠的做法是对体系跑分子动力学，然后从中提取一些帧（可以均匀间隔采样，也可以做周期性退火，取对应0K的帧），然后把靠近溶质的溶剂分子连同溶质提取出来，再用量化方法优化。
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通过SMD溶剂模型描述离子液体溶剂环境的方法 -...
Aug 7, 2018 · 因此，通过SMD溶剂模型描述你用的离子液体，有实验值的参数可以直接用实验值，而没有的就用SMD-GIL给出的离子液体的平均参数代替即可，结果是合理的；或者如果你懒得找实验参数，则所有参数都用SMD-GIL的也完全没问题。
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思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元
Dec 12, 2016 · 2025年10月完结动画简评 文/Sobereva 2025-Dec-6 本文是笔者完整观看过的2025年10月完结的13部全长TV版动画和2部泡面番的简评。 注意其中多多少少有一些剧透的成份，怕被剧透又想了解哪些值得追的话就看评分就好了。
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谈谈分子模拟中的隐式溶剂模型与GB模型 -...
Jun 5, 2015 · 这些新模型理论上有着更好的结果，但仍需广泛地应用于模拟来检验。 还有隐式与显式溶剂模型相结合的方法，也就是在主体分子外面包一层溶剂分子，往往以弹簧势限制住溶剂避免跑走，而更外面则用隐式溶剂模型，结合了两种方法的一些优点。
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求助关于溶剂化能的计算问题 - 量子化学 (Quantum Chemistry) -...
Apr 18, 2025 · 求助各位老师，我按照Sober [/backcolor]eva老师的帖子（http://sobereva.com/490），想计算某化合物的溶剂化能，编写了一个orca的输入文件和运行结果如下，不能运行成功。 ...,计算化学公社